MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY05

Total Repeats: 635

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009471	GTC	2	6	29286	29291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244109
502	NC_009471	ATA	2	6	29308	29313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244109
503	NC_009471	CG	4	8	29405	29412	0 %	0 %	50 %	50 %	148244110
504	NC_009471	TGC	2	6	29436	29441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244110
505	NC_009471	CGC	2	6	29449	29454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244110
506	NC_009471	GGCGC	2	10	29457	29466	0 %	0 %	60 %	40 %	148244110
507	NC_009471	GGC	2	6	29475	29480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244110
508	NC_009471	CGG	2	6	29488	29493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244110
509	NC_009471	TTG	2	6	29494	29499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244110
510	NC_009471	ACG	2	6	29516	29521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244110
511	NC_009471	GGC	2	6	29538	29543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244110
512	NC_009471	CGC	2	6	29645	29650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244110
513	NC_009471	CGA	2	6	30227	30232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244111
514	NC_009471	GAC	2	6	30377	30382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244111
515	NC_009471	GGC	2	6	30543	30548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244111
516	NC_009471	CGA	2	6	30566	30571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244111
517	NC_009471	CGA	2	6	30638	30643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244111
518	NC_009471	ACCT	2	8	30708	30715	25 %	25 %	0 %	50 %	148244111
519	NC_009471	AGC	2	6	30718	30723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244111
520	NC_009471	GAGG	2	8	30726	30733	25 %	0 %	75 %	0 %	148244111
521	NC_009471	TCG	2	6	30796	30801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244111
522	NC_009471	CCG	2	6	30929	30934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244111
523	NC_009471	CAG	2	6	31008	31013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244111
524	NC_009471	CGG	2	6	31024	31029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244111
525	NC_009471	TTCA	2	8	31044	31051	25 %	50 %	0 %	25 %	148244111
526	NC_009471	CCG	2	6	31090	31095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244111
527	NC_009471	CGC	2	6	31124	31129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244111
528	NC_009471	GAT	2	6	31137	31142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244111
529	NC_009471	AGG	2	6	31231	31236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244111
530	NC_009471	GCG	2	6	31241	31246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244111
531	NC_009471	GTC	2	6	31254	31259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244111
532	NC_009471	GCC	2	6	31278	31283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244111
533	NC_009471	ATC	2	6	31284	31289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244111
534	NC_009471	CTC	2	6	31308	31313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244111
535	NC_009471	CCGC	2	8	31380	31387	0 %	0 %	25 %	75 %	148244111
536	NC_009471	GAA	2	6	31524	31529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244112
537	NC_009471	GCGGAG	2	12	31585	31596	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	148244112
538	NC_009471	ATC	2	6	31741	31746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244112
539	NC_009471	CGG	2	6	31820	31825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244112
540	NC_009471	GCA	2	6	31875	31880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244112
541	NC_009471	TTC	2	6	31912	31917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244112
542	NC_009471	CGA	2	6	31941	31946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244112
543	NC_009471	CAA	2	6	31959	31964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244112
544	NC_009471	TGA	2	6	32063	32068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244112
545	NC_009471	GAA	2	6	32076	32081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244112
546	NC_009471	CTG	2	6	32101	32106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244112
547	NC_009471	GGT	2	6	32109	32114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244112
548	NC_009471	GCC	2	6	32284	32289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244112
549	NC_009471	TTCC	2	8	32391	32398	0 %	50 %	0 %	50 %	148244112
550	NC_009471	AACG	2	8	32427	32434	50 %	0 %	25 %	25 %	148244112
551	NC_009471	CG	5	10	32473	32482	0 %	0 %	50 %	50 %	148244112
552	NC_009471	GCT	2	6	32514	32519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244112
553	NC_009471	GGC	2	6	32631	32636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244112
554	NC_009471	GCG	2	6	32747	32752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244113
555	NC_009471	TG	4	8	32756	32763	0 %	50 %	50 %	0 %	148244113
556	NC_009471	CTT	2	6	32788	32793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244113
557	NC_009471	CGG	2	6	32826	32831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244113
558	NC_009471	GC	3	6	32920	32925	0 %	0 %	50 %	50 %	148244113
559	NC_009471	CAGGG	2	10	32927	32936	20 %	0 %	60 %	20 %	148244113
560	NC_009471	CCG	2	6	33058	33063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244113
561	NC_009471	GAT	2	6	33076	33081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244113
562	NC_009471	CGG	2	6	33114	33119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244113
563	NC_009471	GTC	2	6	33127	33132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244113
564	NC_009471	ACG	2	6	33143	33148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244113
565	NC_009471	GCGG	2	8	33163	33170	0 %	0 %	75 %	25 %	148244113
566	NC_009471	GCG	2	6	33238	33243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244113
567	NC_009471	AGC	2	6	33251	33256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244113
568	NC_009471	GC	3	6	33255	33260	0 %	0 %	50 %	50 %	148244113
569	NC_009471	GGC	2	6	33262	33267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244113
570	NC_009471	GAT	2	6	33273	33278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244113
571	NC_009471	GCG	2	6	33290	33295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244113
572	NC_009471	AGC	2	6	33296	33301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244113
573	NC_009471	GC	3	6	33311	33316	0 %	0 %	50 %	50 %	148244113
574	NC_009471	TCG	2	6	33332	33337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244113
575	NC_009471	GCC	2	6	33548	33553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244113
576	NC_009471	CGA	2	6	33585	33590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244113
577	NC_009471	GC	3	6	33614	33619	0 %	0 %	50 %	50 %	148244113
578	NC_009471	TCC	2	6	33623	33628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244113
579	NC_009471	CGG	2	6	33654	33659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244113
580	NC_009471	GCA	2	6	33669	33674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244113
581	NC_009471	GAT	2	6	33718	33723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244113
582	NC_009471	CCT	2	6	33747	33752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244113
583	NC_009471	GCG	2	6	33774	33779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244113
584	NC_009471	GCC	2	6	33786	33791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244113
585	NC_009471	TCG	2	6	33812	33817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244113
586	NC_009471	GCC	2	6	33932	33937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244114
587	NC_009471	AGC	2	6	34049	34054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244114
588	NC_009471	CG	5	10	34086	34095	0 %	0 %	50 %	50 %	148244114
589	NC_009471	CGTT	2	8	34134	34141	0 %	50 %	25 %	25 %	148244114
590	NC_009471	GGAA	2	8	34170	34177	50 %	0 %	50 %	0 %	148244114
591	NC_009471	CGG	2	6	34278	34283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244114
592	NC_009471	ACC	2	6	34454	34459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244114
593	NC_009471	CAG	2	6	34462	34467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244114
594	NC_009471	CGC	2	6	34479	34484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244114
595	NC_009471	TTC	2	6	34487	34492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244114
596	NC_009471	GTTC	2	8	34494	34501	0 %	50 %	25 %	25 %	148244114
597	NC_009471	TTG	2	6	34604	34609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244114
598	NC_009471	TCG	2	6	34622	34627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244114
599	NC_009471	GAA	2	6	34651	34656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244114
600	NC_009471	GCT	2	6	34686	34691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244114
601	NC_009471	CCG	2	6	34743	34748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244114
602	NC_009471	GAT	2	6	34822	34827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244114
603	NC_009471	TTC	2	6	35039	35044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244114
604	NC_009471	GCC	2	6	35078	35083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244114
605	NC_009471	CCAG	2	8	35093	35100	25 %	0 %	25 %	50 %	148244114
606	NC_009471	CGT	2	6	35141	35146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244114
607	NC_009471	GAC	2	6	35345	35350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244115
608	NC_009471	GTC	2	6	35462	35467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244115
609	NC_009471	GCC	2	6	35486	35491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244115
610	NC_009471	GTC	2	6	35492	35497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244115
611	NC_009471	CTC	2	6	35516	35521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244115
612	NC_009471	ACG	2	6	35529	35534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244115
613	NC_009471	GC	3	6	35548	35553	0 %	0 %	50 %	50 %	148244115
614	NC_009471	A	6	6	35943	35948	100 %	0 %	0 %	0 %	148244116
615	NC_009471	GCA	2	6	36078	36083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244116
616	NC_009471	CA	3	6	36100	36105	50 %	0 %	0 %	50 %	148244116
617	NC_009471	CCA	2	6	36145	36150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244116
618	NC_009471	GCA	2	6	36177	36182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244116
619	NC_009471	CGG	2	6	36279	36284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244116
620	NC_009471	GC	3	6	36297	36302	0 %	0 %	50 %	50 %	148244116
621	NC_009471	TGTT	2	8	36304	36311	0 %	75 %	25 %	0 %	148244116
622	NC_009471	TG	3	6	36380	36385	0 %	50 %	50 %	0 %	148244116
623	NC_009471	GGT	2	6	36538	36543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244116
624	NC_009471	CGC	2	6	36575	36580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244116
625	NC_009471	T	6	6	36645	36650	0 %	100 %	0 %	0 %	148244116
626	NC_009471	TGA	2	6	36656	36661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244116
627	NC_009471	AT	4	8	36742	36749	50 %	50 %	0 %	0 %	148244116
628	NC_009471	TGTCG	2	10	36751	36760	0 %	40 %	40 %	20 %	148244116
629	NC_009471	ATG	2	6	36836	36841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244116
630	NC_009471	AGCGG	2	10	36903	36912	20 %	0 %	60 %	20 %	148244116
631	NC_009471	TGG	2	6	36915	36920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244116
632	NC_009471	TCG	3	9	36926	36934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244116
633	NC_009471	GGGT	2	8	37032	37039	0 %	25 %	75 %	0 %	148244116
634	NC_009471	TGG	2	6	37043	37048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244116
635	NC_009471	GAT	2	6	37091	37096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244116

< Previous 12Next >